ФНС отметила, что согласно п. 6.2 ст. 210 НК РФ налоговая база по НДФЛ, в отношении которой применяются налоговая ставки 13 и 15%, определяется по доходам в виде оплаты труда (денежного довольствия, денежного содержания), получаемой (получаемого) лицами, работающими (служащими) в районах Крайнего Севера, приравненных к ним местностях, в части, относящейся к установленным в соответствии с законодательством РФ районным коэффициентам к заработной плате и процентным надбавкам к заработной плате за работу (службу) в данных районах или местностях.
При этом налоговая ставка по НДФЛ устанавливается в размерах:
- 13 %, если сумма налоговых баз, указанных в пунктах 6.1 и 6.2 ст. 210 НК РФ, за налоговый период составляет не более 5 миллионов рублей;
- 15 % и 650 тысяч рублей, если суммы налоговых баз, указанных в пунктах 6.1 и 6.2 ст. 210 НК РФ, превышающей 5 миллионов рублей.
Между тем, согласно ст. 139 ТК РФ и п. 2 Положения об особенностях порядка исчисления средней заработной платы, утвержденного Постановлением Правительства Российской Федерации от 24.12.2007 № 922 «Об особенностях порядка исчисления средней заработной платы» для расчета среднего заработка, учитываются все предусмотренные системой оплаты труда виды выплат, применяемые у соответствующего работодателя, независимо от источников этих выплат, в том числе выплаты, обусловленные районным регулированием оплаты труда - коэффициенты и процентные надбавки к заработной плате.
Таким образом, налоговая ставка, предусмотренная п. 1.2 статьи 224 НК РФ, применяется, в частности, к выплатам (например, оплата отпуска), рассчитанным исходя из средней заработной платы, относящихся к суммам районных коэффициентов и надбавок, которые выплачиваются в связи с работой в районах Крайнего Севера или приравненных к ним местностях.