Минфин России в письме от 30.08.2021 № 03-07-14/69863 напоминает, что на основании п. 11 и 12 ст. 346.43 НК РФ индивидуальные предприниматели на патенте не признаются плательщиками НДС (исключение – НДС, уплачиваемый налоговым агентом, а также при импорте товаров). Соответственно, по общему правилу они не составляют счета-фактуры.
При этом, пишет ведомство, как следует из подп. 1 п. 5 ст. 173 НК РФ, налогоплательщик в случае выставления покупателю счета-фактуры с выделением сумм НДС обязан уплатить соответствующие суммы в бюджет в полном объеме в общеустановленном порядке. Таким образом, ИП на ПСН по просьбе контрагента может предъявить второму счет-фактуру с выделенным НДС, но в этом случае ИП должен будет заплатить соответствующий налог в бюджет.
Подробно об оформлении счета-фактуры для другого спецрежима — УСН, мы писали здесь; для ПСН счет-фактура оформляется аналогично.