Минфин России в письме от 26.01.2021 № 03-04-05/4490 указывает, что на основании п. 1 ст. 231 НК РФ излишне удержанная налоговым агентом сумма НДФЛ из дохода налогоплательщика подлежит возврату данным агентом на основании письменного заявления налогоплательщика, и отмечает, что порядок применения норм ст. 231 НК РФ не зависит от налогового периода, в котором производится возврат излишне удержанного налога.
При этом в рамках процедуры соответствующего возврата применяются общие нормы ст. 78 НК РФ.
Так, в соответствии с п.7 ст. 78 НК РФ заявление о возврате суммы излишне уплаченного НДФЛ может быть подано в течение 3 лет со дня уплаты соответствующей суммы. Данное правило, таким образом, применяется не только в отношении возврата НДФЛ из бюджета, но и налоговым агентом тоже.
Подробно о том, как вернуть или зачесть переплату по НДФЛ налоговому агенту мы писали здесь; как физлицу самостоятельно вернуть налоговую переплату - здесь.