Минфин России в письме от 22.04.2021 № 03-07-11/30538 указывает, что положения п. 2.1 ст. 170 и подп. 6 п. 3 ст. 170 НК РФ в связи с получением организацией-собственником инженерных сетей и линий связи денежной компенсации в виде возмещения убытков, не применяются в силу действия положений постановления правительства Москвы от 25.07.2011 № 333-ПП.
В соответствии с п. 2.1 ст. 170 НК РФ, при приобретении товаров (работ, услуг) за счет бюджетных субсидий или инвестиций, суммы НДС, предъявленные налогоплательщику, вычету не подлежат. В свою очередь, согласно подп. 6 п. 3 ст. 170 НК РФ, суммы НДС, принятые к вычету налогоплательщиком, подлежат восстановлению в случае получения налогоплательщиком соответствующих бюджетных субсидий или инвестиций.
При этом, постановлением № 333-ПП утвержден Порядок осуществления денежной компенсации собственникам инженерных сетей и линий связи, подлежащих сносу или восстановлению в процессе возведения объектов капитального строительства, осуществляемого за счет средств столичного бюджета.
Порядком предусмотрено, что собственники подлежащих сносу или восстановлению инженерных сетей и линий связи не являются получателями субсидий на осуществление капитальных вложений. В данном случае поступающие от государственного заказчика денежные средства являются компенсацией таким собственникам убытков в связи со сносом и восстановлением имущества в целях освобождения территории для строительства.
Таким образом, НДС по соответствующим компенсациям принимается к вычету и, в свою очередь, не подлежит восстановлению.